Výběr správného léku je v homeopatii jedním z nejtěžších úkolů. Vyžaduje hluboké znalosti, roky studia a neustálé další vzdělávání v homeopatii. Mnoho pacientů ani netuší, co všechno musí dobrý homeopat znát, aby mohl správně určit vhodný lék. A ani tehdy to není vždy jednoduché – někdy se prostě nepodaří najít ten správný lék hned napoprvé.
Často pak lidé začnou být vůči homeopatii skeptičtí a myslí si, že nefunguje. Přitom jsou ale ochotni užívat opakovaně antibiotika nebo dlouhodobě brát kortikoidy, aniž by se pozastavili nad tím, že ani tato léčba někdy nepřináší výsledky. Když potom v homeopatii první předepsaný lék nezabere, bývá jejich důvěra rychle pryč.
V homeopatii je pro pacienty velmi důležité i tzv. „čekání“. Tedy období, kdy organismus reaguje na podaný lék.
Po podání správného homeopatického léku by mělo nejprve dojít ke krátkodobému homeopatickému zhoršení. Poté se stav začne postupně zlepšovat. Každý člověk však reaguje jinak, a proto i doba potřebná k uzdravení je u každého individuální.
Například ekzém, který má člověk roky, nelze vyléčit během pár dnů. Někdy je potřeba k vyléčení i několik homeopatických léků za sebou, ale opět je to velmi individuální u každého člověka, protože každý má jiné potíže na fyzické, emoční i mentální rovině.
Proto je tak důležité čekat na odezvu organismu po správném homeopatickém léku. Příliš brzké podání dalšího homeopatického léku by mohlo narušit správný vývoj účinku prvního léku.
Ale v případě akutních onemocnění bývá zlepšení stavu po správném léku velmi rychlé, často během několika hodin nebo dnů.